关于python：如何在GitHub上保存代码文件并在Jupyter笔记本上运行？

How to save code file on GitHub and run on Jupyter notebook?

使用GitHub，我们可以在线存储我们的代码，而使用Jupyter笔记本，我们只能执行一段Python代码。我想一起使用它们。我能够使用存储在我的计算机上的Jupyter笔记本编辑代码。但是，我无法找到一种方法来运行存储在GitHub上的代码。那么，你知道一种方法吗？

这里有些例子：
https://github.com/biolab/ipynb/blob/master/2015-bi/lcs.ipynb
https://github.com/julienr/ipynb_playground/blob/master/misc_ml/curse_dimensionality.ipynb
https://github.com/rvuduc/cse6040-ipynbs/blob/master/01--intro-py.ipynb

1.如果您只想运行在Github上或Gist中托管的Python代码：

如本文提示＃8中所述，IPython Magic命令%load将用外部脚本替换Jupyter笔记本单元的内容。

源可以是您计算机上的文件或URL。
使用Github或Gist托管脚本的技巧是将其指向原始代码的URL。您可以通过浏览GitHub上的脚本并在代码上方的工具栏中按Raw轻松获取该URL。结合从地址栏中提取的内容，得到以下内容：

1	%load https://raw.githubusercontent.com/dib-lab/khmer/master/scripts/fastq-to-fasta.py

当您在Jupyter笔记本单元格中执行它时，这会将代码拉入笔记本的命名空间。
有关在此处和此处通过GitHub或Gists使用原始代码的更多信息。有关其他魔术命令的更多信息，请点击此处。

同样，如果要将脚本作为文件引入，可以使用%run(或从等效命令行)在笔记本中调用，在笔记本单元格中使用curl，脚本将添加到当前目录中。

1	!curl -O https://raw.githubusercontent.com/dib-lab/khmer/master/scripts/fastq-to-fasta.py

2.如果要运行放在GitHub上的笔记本：

或者，如果您希望其他人能够轻松运行该笔记本。
查看本篇Nature文章中突出显示的MyBinder.org。有关该服务的更多信息可以在这里，这里和这里找到。

在MyBinder.org页面，您可以将服务指向任何Github存储库。但需要注意的是，除非它在笔记本中是相当普通的python，否则你会遇到依赖问题。您可以将其设置为按照此处和此处的指导进行处理。
这是为了生成这个可启动的仓库，之后我分配了一个尚未设置为最初使用Binder系统的仓库。另一个例子，这个R代码，基于在twitter交易平台上共享的要点，可以在这里看到。

使用它，您可以获得Launch Binder徽章，您可以将其添加到存储库并随时启动它。查看您可以在此处启动的示例。