Why is reading lines from stdin much slower in C++ than Python?
我想用Python和C++来比较STDIN中的字符串输入的读取行,并震惊地看到我的C++代码运行速度比等效的Python代码慢了一个数量级。因为我的C++是生疏的,我还不是一个专家,请告诉我,如果我做错了什么,或者如果我误解了什么。
(TLDR回答:包括声明:
TLDR结果:一直向下滚动到问题的底部,然后查看表格。)
C++代码:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 | #include <iostream> #include <time.h> using namespace std; int main() { string input_line; long line_count = 0; time_t start = time(NULL); int sec; int lps; while (cin) { getline(cin, input_line); if (!cin.eof()) line_count++; }; sec = (int) time(NULL) - start; cerr <<"Read" << line_count <<" lines in" << sec <<" seconds."; if (sec > 0) { lps = line_count / sec; cerr <<" LPS:" << lps << endl; } else cerr << endl; return 0; } // Compiled with: // g++ -O3 -o readline_test_cpp foo.cpp |
python等价物:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 | #!/usr/bin/env python import time import sys count = 0 start = time.time() for line in sys.stdin: count += 1 delta_sec = int(time.time() - start_time) if delta_sec >= 0: lines_per_sec = int(round(count/delta_sec)) print("Read {0} lines in {1} seconds. LPS: {2}".format(count, delta_sec, lines_per_sec)) |
以下是我的结果:
1 2 3 4 5 | $ cat test_lines | ./readline_test_cpp Read 5570000 lines in 9 seconds. LPS: 618889 $cat test_lines | ./readline_test.py Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 |
我需要注意的是,我在Mac OS X v10.6.8(雪豹)和Linux 2.6.32(Red Hat Linux 6.2)下都尝试过。前者是一个MacBookPro,后者是一个非常强大的服务器,而不是说这太中肯了。
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 | $ for i in {1..5}; do echo"Test run $i at `date`"; echo -n"CPP:"; cat test_lines | ./readline_test_cpp ; echo -n"Python:"; cat test_lines | ./readline_test.py ; done Test run 1 at Mon Feb 20 21:29:28 EST 2012 CPP: Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889 Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 Test run 2 at Mon Feb 20 21:29:39 EST 2012 CPP: Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889 Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 Test run 3 at Mon Feb 20 21:29:50 EST 2012 CPP: Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889 Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 Test run 4 at Mon Feb 20 21:30:01 EST 2012 CPP: Read 5570001 lines in 9 seconds. LPS: 618889 Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 Test run 5 at Mon Feb 20 21:30:11 EST 2012 CPP: Read 5570001 lines in 10 seconds. LPS: 557000 Python:Read 5570000 lines in 1 seconds. LPS: 5570000 |
微小基准附录和摘要
为了完整起见,我想我会用原来的(同步)C++代码更新同一个文件上的读取速度。同样,这是用于快速磁盘上的100M行文件。以下是与几种解决方案/方法的比较:
1 2 3 4 5 6 | Implementation Lines per second python (default) 3,571,428 cin (default/naive) 819,672 cin (no sync) 12,500,000 fgets 14,285,714 wc (not fair comparison) 54,644,808 |
默认情况下,
1 | std::ios_base::sync_with_stdio(false); |
通常,当一个输入流被缓冲时,而不是一次读取一个字符,该流将以更大的块读取。这减少了系统调用的数量,而系统调用通常比较昂贵。然而,由于基于
1 2 3 4 | int myvalue1; cin >> myvalue1; int myvalue2; scanf("%d",&myvalue2); |
如果
为了避免这种情况,默认情况下,流与
幸运的是,库设计人员决定,如果您知道自己在做什么,也应该能够禁用此功能以获得更好的性能,因此他们提供了
出于好奇,我看了看引擎盖下面发生了什么,并在每个测试中使用了DTruss/Strace。
C++
1 2 | ./a.out < in Saw 6512403 lines in 8 seconds. Crunch speed: 814050 |
系统调用
1 2 3 4 5 6 7 8 9 | CALL COUNT __mac_syscall 1 <snip> open 6 pread 8 mprotect 17 mmap 22 stat64 30 read_nocancel 25958 |
Python
1 2 | ./a.py < in Read 6512402 lines in 1 seconds. LPS: 6512402 |
系统调用
1 2 3 4 5 6 7 8 | CALL COUNT __mac_syscall 1 <snip> open 5 pread 8 mprotect 17 mmap 21 stat64 29 |
我落后了几年,但是:好的。
在原始日志的"编辑4/5/6"中,您使用的是结构:好的。
1 | $ /usr/bin/time cat big_file | program_to_benchmark |
这在两个不同的方面是错误的:好的。
实际上,您是在计时"cat"的执行,而不是您的基准。"time"显示的"user"和"sys"CPU使用率是"cat"的使用率,而不是基准程序的使用率。更糟糕的是,"实时"时间也不一定准确。根据"cat"和本地操作系统中管道的实现情况,"cat"可能会在读卡器进程完成工作之前编写最终的巨大缓冲区并退出。好的。
使用"cat"是不必要的,实际上会适得其反;你在添加运动部件。如果您使用的是一个足够旧的系统(即只有一个CPU,在某些代的计算机中,I/O速度比CPU快),那么仅仅运行"cat"这个事实就可以大大改变结果。您还需要服从输入和输出缓冲以及其他处理'cat'。(如果我是Randal Schwartz,这很可能会给你赢得"无用的猫使用"奖。好的。
更好的结构是:好的。
1 | $ /usr/bin/time program_to_benchmark < big_file |
在这个语句中,它是一个shell,它打开一个大的文件,并将其作为一个已经打开的文件描述符传递给您的程序(实际上是传递给"time",然后作为子进程执行您的程序)。100%的文件读取是您要测试的程序的严格责任。这可以让您真正了解它的性能,而不会出现虚假的复杂情况。好的。
我将提到两个可能的,但实际上是错误的,"修复"也可以考虑(但我用不同的方式对它们进行"编号",因为这些不是原始帖子中出错的内容):好的。
a.您可以通过只对程序进行计时来"修复"此问题:好的。
1 | $ cat big_file | /usr/bin/time program_to_benchmark |
b.或通过对整个管道进行计时:好的。
1 | $ /usr/bin/time sh -c 'cat big_file | program_to_benchmark' |
这些错误的原因与2相同:他们仍然不必要地使用"cat"。我提到它们有几个原因:好的。
对于那些对posix shell的I/O重定向功能不太满意的人来说,它们更为"自然"。好的。
在某些情况下,可能需要'cat'(例如:要读取的文件需要某种访问权限,而您不想将该权限授予要基准化的程序:'sudo cat/dev/sda/usr/bin/time my_compression_test--no output`)好的。
在实践中,在现代机器上,管道中添加的"cat"可能没有实际意义。好的。
但我迟疑地说了最后一句话。如果我们在"编辑5"中检查最后一个结果--好的。
1 2 | $ /usr/bin/time cat temp_big_file | wc -l 0.01user 1.34system 0:01.83elapsed 74%CPU ... |
--这表明"cat"在测试期间消耗了74%的CPU;实际上,1.34/1.83大约是74%。也许是一段:好的。
1 | $ /usr/bin/time wc -l < temp_big_file |
只剩下0.49秒!可能不是这样:"cat"必须支付read()系统调用(或等效调用)的费用,该调用从"disk"(实际上是缓冲区缓存)传输文件,以及将文件传输到"wc"的管道写入。正确的测试仍然需要执行那些read()调用;只有对pipe的写操作和从pipe调用中读取的操作才能被保存,而且这些操作应该非常便宜。好的。
不过,我预测你可以测量'cat file_wc-l'和'wc-l
1 2 3 4 5 6 | $ time wc -l < /tmp/junk real 0.280s user 0.156s sys 0.124s (total cpu 0.280s) $ time cat /tmp/junk | wc -l real 0.407s user 0.157s sys 0.618s (total cpu 0.775s) $ time sh -c 'cat /tmp/junk | wc -l' real 0.411s user 0.118s sys 0.660s (total cpu 0.778s) |
注意,这两个管道结果声称花费的CPU时间(user+sys)比实时时间多。这是因为我使用的是shell(bash)的内置"time"命令,它了解管道;我在一台多核机器上,管道中的独立进程可以使用独立的内核,从而比实时更快地累积CPU时间。使用/usr/bin/time,我发现CPU时间比实时时间要短——这表明它只能在命令行上对传递给它的单个管道元素计时。此外,shell的输出给出毫秒,而/usr/bin/time只给出百分之一秒。好的。
因此,在"wc-l"的效率水平上,"cat"有着巨大的区别:409/283=1.453或45.3%的实时性,775/280=2.768,或高达177%的CPU使用率!随机地,它就在时间测试箱里。好的。
我应该补充一点,在这些测试风格之间,至少还有一个显著的区别,我不能说这是有益的还是错误的;您必须自己决定:好的。
当你运行"cat big_file/usr/bin/time my_program"时,你的程序正以"cat"发送的速度从管道接收输入,并以不大于"cat"写入的块的形式接收输入。好的。
当您运行`/usr/bin/time my_program
我在我的电脑上用Mac电脑上的G++复制了原始结果。
在EDCOX1的12个循环之前,将下面的语句添加到C++版本中,使其与Python版本内联:
1 2 3 | std::ios_base::sync_with_stdio(false); char buffer[1048576]; std::cin.rdbuf()->pubsetbuf(buffer, sizeof(buffer)); |
同步与stdio将速度提高到2秒,设置更大的缓冲区将速度降低到1秒。
如果您不关心文件加载时间或加载小文本文件,那么
下面是一个例子:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 | //open file in binary mode std::fstream file( filename, std::ios::in|::std::ios::binary ); if( !file ) return NULL; //read the size... file.seekg(0, std::ios::end); size_t length = (size_t)file.tellg(); file.seekg(0, std::ios::beg); //read into memory buffer, then close it. char *filebuf = new char[length+1]; file.read(filebuf, length); filebuf[length] = '\\0'; //make it null-terminated file.close(); |
如果需要,可以将流环绕在该缓冲区周围,以便更方便地访问,如下所示:
1 | std::istrstream header(&filebuf[0], length); |
此外,如果您控制文件,请考虑使用平面二进制数据格式而不是文本。读写更可靠,因为你不必处理空白区的所有含糊不清之处。它也更小,解析速度更快。
顺便说一下,C++版本的行计数比Python版本的计数大的原因是,当试图读取EOF时,EOF标记只被设置。所以正确的循环应该是:
1 2 3 4 5 6 | while (cin) { getline(cin, input_line); if (!cin.eof()) line_count++; }; |
以下代码对我来说比这里发布的其他代码快:(Visual Studio 2013,64位500 MB文件,行长一致,格式为[0,1000])。
1 2 3 4 5 6 7 | const int buffer_size = 500 * 1024; // Too large/small buffer is not good. std::vector<char> buffer(buffer_size); int size; while ((size = fread(buffer.data(), sizeof(char), buffer_size, stdin)) > 0) { line_count += count_if(buffer.begin(), buffer.begin() + size, [](char ch) { return ch == '\ '; }); } |
它比我所有的python尝试都快了一倍多。
在第二个示例中(使用scanf())原因可能是scanf("%s")解析字符串并查找任何空格字符(space、tab、newline)。
另外,是的,cpython做了一些缓存以避免硬盘读取。
答案的第一个要素是:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 | #include <iostream> #include <time.h> #include <cstdio> using namespace std; int main() { char buffer[10000]; long line_count = 0; time_t start = time(NULL); int sec; int lps; int read = 1; while(read > 0) { read = scanf("%s", buffer); line_count++; }; sec = (int) time(NULL) - start; line_count--; cerr <<"Saw" << line_count <<" lines in" << sec <<" seconds." ; if (sec > 0) { lps = line_count / sec; cerr <<" Crunch speed:" << lps << endl; } else cerr << endl; return 0; } |
好吧,我看到在你的第二个解决方案中,你从
顺便说一句,不知道同步的事,很好。但你还是应该试试