最近对病理切片的识别和检测算法突然有点兴趣，就想着去GitHub上看看有没有相关算法可以学习。经过搜索后，发现baidu-research的NCRF开源算法，标星600多，还有相关论文，效果嘛倒也不错，于是决定就是它了。

先来看看依赖， python3.6，numpy1.14.3，pytorch0.3.1。看到这里笔者心头一凉，如果没记错的话pytorch已经发布1.5稳定版了，这个0.3.1会不会有什么坑啊，不管了，先把最新版本的装起来看看报什么错再说吧。

第一步先准备数据，按照给定的链接打开CAMELYON16的比赛网站，发现数据要去CAMELYON17的主页上获取，心里顿时没了底，这数据到底还下不下的到呢？还好，在网站上提供了百度网盘的下载方式，点进去也发现文件还在。不过这里不得不吐槽一下不开会员的这个下载速度，700G的数据几KB的速度，不得已只能冲个会员了。

等代码和数据都上传到服务器已经一天过去了。下面正式来到代码调试阶段，第一步是Patch images。输入以下命令，根据实际情况调整路径应该就行了吧。

额，果然不行呢， 报错如下错误：

openslide.lowlevel.OpenSlideUnsupportedFormatError: Unsupported or missing image file

是不是下载的时候出错呢，把对应文件重新长传一次后发现还是报相同的错误。这个时候发现tumor_train.txt是这样的：

我们下载的文件是这样的：

应该就是这个大小写的问题了把，那就简单了，把文件名改了，或者把列表改了就行了。果然，开始切分数据这块正常运行了，这里笔者用了5个线程，共耗时5个小时把数据都准备完成。

那下一步就是模型训练了，输入命令，等待报错吧。。。

这里需要用到一个cfg.json，里面有一些路径参数需要根据实际环境调整，因为比较简单先略去不表。

SyntaxError，看来这个async=True有问题。赶紧查一下，

原来如此，按照这个改了以后，又报了这个：

好复杂，看起来是多线程没跑起来，难道写的class里面还有什么错。不管了先去这个image_producer.py里面看看这一行：

if self._annotations[pid].inside_polygons((x, y), True):

好像没啥问题，再去annotation.py里面看看定义，也没问题啊。那我们把这个pid print出来看一下。等等这个KeyError:'tumor_024'开头是小写，我记得文件名是大写来着，看来还是刚才那个问题，在一个坑里摔倒2次，真的是。。。

改完以后，又报错咯。。。按下面大大给的方法改完

按下面大大给的方法改完，终于跑起来了

总结下来，调别人的代码可能会碰到一些历史遗留问题，比如大小写可能因为原始环境是windows而产生的，之后只要解决版本语法的改变基本就可以调通了。这次折腾了2天多，后面还有画图啥的，等到有空再弄把。

最后，吃一把鸡压压惊 。