ImageJ是NIH开发的基于Java的图像处理软件。
它被用作生物学研究的标准。

ImageJ是开源的，因此有很多发行版本，斐济尤其受欢迎。这就是为什么它被称为"斐济只是ImageJ"的原因。
当您在图像分析中认为"我想进行这种处理"时，斐济具有大多数功能。 (但是，高级功能除外。让我们在MATLAB或Python中实现高级功能。)

以下是使用ImageJ的基本功能的摘要。

货号

例如，如果您拍摄视频，ImageJ会将其作为多张图像的集合加载。保存时，如果为tif格式，则可以将多个图像作为一组(堆栈)保存在一个文件中。
作为堆栈，在时间轴方向上有一个连接，就像电影一样，但是当深度(z方向)改变时，还有其他堆栈(即，通过切片3D数据制成的堆栈)和RGB。 (通道)由于波长的差异。
在ImageJ中，这三个连接可以分成一个堆栈，并且可以处理最多5D信息的超级堆栈。
超级堆栈也可以另存为tif文件。但是，如果您使用MATLAB等阅读此内容，则5D堆栈也将被读取为3D。顺序是通道，z堆栈和时间堆栈。

查找

一个常见的任务是使用[图像]选项卡中[调整]下的[亮度/对比度]线性转换亮度。您也可以使用查找表更改颜色。
关键是图像的亮度值根本不会改变，因为LookUp仅会改变外观。
我只是在更改显示方法。如果您用其他软件查看保存的文件，则可能根本不会更改。
但是，当您按下[Apply]按钮时，会采用外观，并且亮度值会改变。

投资回报率(关注区域)

是指定图像区域并进行标记并将像素设置为关注区域的功能。
对于堆叠的图像，您还可以指定和标记切片。
方形和圆形按钮是如何获取投资回报率的设置。
您可以在ROI管理员中注册[crtl key t]命令附带的ROI。
[测量]显示该区域的信息。
ROI可以作为叠加层附加到图像，也可以另存为图像的roi文件。

元信息

您还可以设置元信息，例如每像素的长度(即分辨率)，并将其保存为tif文件格式。信息可以在[Properties ...]等中找到。
您还可以根据此长度信息在[Scale bar ...]中添加一个比例尺。

宏

宏是记录和自动化一系列过程的函数。
记录从[插件]的[宏]的[记录...]开始，然后记录您完成的处理。它类似于Excel宏，非常有用。宏可以另存为ijm文件。

插件

与

宏类似，但是具有扩展ImageJ功能的能力。 ImageJ主页上介绍了许多插件。将jar文件(已编译的Java可执行文件)放在plugin文件夹中，它将被安装。
您也可以开发自己的插件并用Java编写。